# coding=utf-8 # Author:Dodo # Date:2018-11-17 # Email:lvtengchao@pku.edu.cn ''' 数据集:Mnist 训练集数量:60000 测试集数量:10000 ------------------------------ 运行结果: 正确率:84.3% 运行时长:103s ''' import numpy as np import time def loadData(fileName): ''' 加载文件 :param fileName:要加载的文件路径 :return: 数据集和标签集 ''' #存放数据及标记 dataArr = []; labelArr = [] #读取文件 fr = open(fileName) #遍历文件中的每一行 for line in fr.readlines(): #获取当前行,并按“,”切割成字段放入列表中 #strip:去掉每行字符串首尾指定的字符(默认空格或换行符) #split:按照指定的字符将字符串切割成每个字段,返回列表形式 curLine = line.strip().split(',') #将每行中除标记外的数据放入数据集中(curLine[0]为标记信息) #在放入的同时将原先字符串形式的数据转换为整型 #此外将数据进行了二值化处理,大于128的转换成1,小于的转换成0,方便后续计算 dataArr.append([int(int(num) > 128) for num in curLine[1:]]) #将标记信息放入标记集中 #放入的同时将标记转换为整型 labelArr.append(int(curLine[0])) #返回数据集和标记 return dataArr, labelArr def NaiveBayes(Py, Px_y, x): ''' 通过朴素贝叶斯进行概率估计 :param Py: 先验概率分布 :param Px_y: 条件概率分布 :param x: 要估计的样本x :return: 返回所有label的估计概率 ''' #设置特征数目 featrueNum = 784 #设置类别数目 classNum = 10 #建立存放所有标记的估计概率数组 P = [0] * classNum #对于每一个类别,单独估计其概率 for i in range(classNum): #初始化sum为0,sum为求和项。 #在训练过程中对概率进行了log处理,所以这里原先应当是连乘所有概率,最后比较哪个概率最大 #但是当使用log处理时,连乘变成了累加,所以使用sum sum = 0 #获取每一个条件概率值,进行累加 for j in range(featrueNum): sum += Px_y[i][j][x[j]] #最后再和先验概率相加(也就是式4.7中的先验概率乘以后头那些东西,乘法因为log全变成了加法) P[i] = sum + Py[i] #max(P):找到概率最大值 #P.index(max(P)):找到该概率最大值对应的所有(索引值和标签值相等) return P.index(max(P)) def model_test(Py, Px_y, testDataArr, testLabelArr): ''' 对测试集进行测试 :param Py: 先验概率分布 :param Px_y: 条件概率分布 :param testDataArr: 测试集数据 :param testLabelArr: 测试集标记 :return: 准确率 ''' #错误值计数 errorCnt = 0 #循环遍历测试集中的每一个样本 for i in range(len(testDataArr)): #获取预测值 presict = NaiveBayes(Py, Px_y, testDataArr[i]) #与答案进行比较 if presict != testLabelArr[i]: #若错误 错误值计数加1 errorCnt += 1 #返回准确率 return 1 - (errorCnt / len(testDataArr)) def getAllProbability(trainDataArr, trainLabelArr): ''' 通过训练集计算先验概率分布和条件概率分布 :param trainDataArr: 训练数据集 :param trainLabelArr: 训练标记集 :return: 先验概率分布和条件概率分布 ''' #设置样本特诊数目,数据集中手写图片为28*28,转换为向量是784维。 # (我们的数据集已经从图像转换成784维的形式了,CSV格式内就是) featureNum = 784 #设置类别数目,0-9共十个类别 classNum = 10 #初始化先验概率分布存放数组,后续计算得到的P(Y = 0)放在Py[0]中,以此类推 #数据长度为10行1列 Py = np.zeros((classNum, 1)) #对每个类别进行一次循环,分别计算它们的先验概率分布 #计算公式为书中"4.2节 朴素贝叶斯法的参数估计 公式4.8" for i in range(classNum): #下方式子拆开分析 #np.mat(trainLabelArr) == i:将标签转换为矩阵形式,里面的每一位与i比较,若相等,该位变为Ture,反之False #np.sum(np.mat(trainLabelArr) == i):计算上一步得到的矩阵中Ture的个数,进行求和(直观上就是找所有label中有多少个 #为i的标记,求得4.8式P(Y = Ck)中的分子) #np.sum(np.mat(trainLabelArr) == i)) + 1:参考“4.2.3节 贝叶斯估计”,例如若数据集总不存在y=1的标记,也就是说 #手写数据集中没有1这张图,那么如果不加1,由于没有y=1,所以分子就会变成0,那么在最后求后验概率时这一项就变成了0,再 #和条件概率乘,结果同样为0,不允许存在这种情况,所以分子加1,分母加上K(K为标签可取的值数量,这里有10个数,取值为10) #参考公式4.11 #(len(trainLabelArr) + 10):标签集的总长度+10. #((np.sum(np.mat(trainLabelArr) == i)) + 1) / (len(trainLabelArr) + 10):最后求得的先验概率 Py[i] = ((np.sum(np.mat(trainLabelArr) == i)) + 1) / (len(trainLabelArr) + 10) #转换为log对数形式 #log书中没有写到,但是实际中需要考虑到,原因是这样: #最后求后验概率估计的时候,形式是各项的相乘(“4.1 朴素贝叶斯法的学习” 式4.7),这里存在两个问题:1.某一项为0时,结果为0. #这个问题通过分子和分母加上一个相应的数可以排除,前面已经做好了处理。2.如果特诊特别多(例如在这里,需要连乘的项目有784个特征 #加一个先验概率分布一共795项相乘,所有数都是0-1之间,结果一定是一个很小的接近0的数。)理论上可以通过结果的大小值判断, 但在 #程序运行中很可能会向下溢出无法比较,因为值太小了。所以人为把值进行log处理。log在定义域内是一个递增函数,也就是说log(x)中, #x越大,log也就越大,单调性和原数据保持一致。所以加上log对结果没有影响。此外连乘项通过log以后,可以变成各项累加,简化了计算。 #在似然函数中通常会使用log的方式进行处理(至于此书中为什么没涉及,我也不知道) Py = np.log(Py) #计算条件概率 Px_y=P(X=x|Y = y) #计算条件概率分成了两个步骤,下方第一个大for循环用于累加,参考书中“4.2.3 贝叶斯估计 式4.10”,下方第一个大for循环内部是 #用于计算式4.10的分子,至于分子的+1以及分母的计算在下方第二个大For内 #初始化为全0矩阵,用于存放所有情况下的条件概率 Px_y = np.zeros((classNum, featureNum, 2)) #对标记集进行遍历 for i in range(len(trainLabelArr)): #获取当前循环所使用的标记 label = trainLabelArr[i] #获取当前要处理的样本 x = trainDataArr[i] #对该样本的每一维特诊进行遍历 for j in range(featureNum): #在矩阵中对应位置加1 #这里还没有计算条件概率,先把所有数累加,全加完以后,在后续步骤中再求对应的条件概率 Px_y[label][j][x[j]] += 1 #第二个大for,计算式4.10的分母,以及分子和分母之间的除法 #循环每一个标记(共10个) for label in range(classNum): #循环每一个标记对应的每一个特征 for j in range(featureNum): #获取y=label,第j个特诊为0的个数 Px_y0 = Px_y[label][j][0] #获取y=label,第j个特诊为1的个数 Px_y1 = Px_y[label][j][1] #对式4.10的分子和分母进行相除,再除之前依据贝叶斯估计,分母需要加上2(为每个特征可取值个数) #分别计算对于y= label,x第j个特征为0和1的条件概率分布 Px_y[label][j][0] = np.log((Px_y0 + 1) / (Px_y0 + Px_y1 + 2)) Px_y[label][j][1] = np.log((Px_y1 + 1) / (Px_y0 + Px_y1 + 2)) #返回先验概率分布和条件概率分布 return Py, Px_y if __name__ == "__main__": start = time.time() # 获取训练集 print('start read transSet') trainDataArr, trainLabelArr = loadData('../Mnist/mnist_train.csv') # 获取测试集 print('start read testSet') testDataArr, testLabelArr = loadData('../Mnist/mnist_test.csv') #开始训练,学习先验概率分布和条件概率分布 print('start to train') Py, Px_y = getAllProbability(trainDataArr, trainLabelArr) #使用习得的先验概率分布和条件概率分布对测试集进行测试 print('start to test') accuracy = model_test(Py, Px_y, testDataArr, testLabelArr) #打印准确率 print('the accuracy is:', accuracy) #打印时间 print('time span:', time.time() -start)